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Title: PCR cuantitativa para la detección del virus de la tristeza de los cítricos en Colombia
Other Titles: Quantitative PCR for detection of Citrus tristeza virus in Colombia
Authors: Solano Luna, Luis Miguel
Chavarro Mesa, Edisson
Angel Díaz, Jorge Evelio
Keywords: Frutas cítricas - Control integrado
Cítricos - Cultivo
Cítricos - Enfermedades y plagas
Closterovirus tristeza del citrus
Virosis (Plantas)
Virus de la tristeza de los cítricos
Closterovirus
Cuantificación absoluta
Detección de patógenos vegetales
Enfermedades de los cítricos
PCR en tiempo real SYBR Green
Issue Date: 1-Jan-2018
Publisher: Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia
Citation: Solano Luna, L. M., Chavarro Mesa, E. & Angel Díaz, J. E. (2018). PCR cuantitativa para la detección del virus de la tristeza de los cítricos en Colombia. Ciencia y Agricultura, 15(1), 7-18. DOI: https://doi.org/10.19053/01228420.v15.n1.2018.7789. http://repositorio.uptc.edu.co/handle/001/2291
Abstract: Se aplicó la técnica de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (qRT-PCR), usando SYBR Green para la detección específica del virus de la tristeza de los cítricos (CTV) en Colombia. Una pareja de iniciadores, diseñados a partir de secuencias conservadas en los marcos abiertos de lectura (ORF’s) 1b y 2, permitió amplificar el ARN genómico (ARNg), y un producto de 186 pb fue obtenido sin la presencia de dímeros o inespecificidad. El análisis de la curva de fusión mostró un pico entre 81 oC y 83 oC, con un coeficiente de correlación de 0,998 y una eficiencia de 99,1 %. La curva estándar se desarrolló a partir de una amplificación del producto de 186 pb y permitió realizar un análisis cuantitativo de las muestras, con un rango de detección de 1x108 hasta 1x103 copias de RNAg y con valores de coeficiente de variación bajos. La acumulación de CTV fue más alta en tejido foliar y en frutos que en corteza; entretanto, las diferencias demostradas entre varias especies de cítricos susceptibles a la infección fueron mínimas. Los resultados de este trabajo muestran que la mayor concentración de virus se encontró en el tercio superior de las plantas analizadas, seguida por el tercio bajo y, por último, el tercio medio. La qRT-PCR es un método específico y sensible de interés práctico en los procesos de detección de las enfermedades virales presentes en el cultivo de los cítricos y otros cultivos de interés comercial.
Description: 1 recurso en línea (páginas 7-18).
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URI: http://repositorio.uptc.edu.co/handle/001/2291
ISSN: 2539-0899
Series/Report no.: Revista Ciencia y Agricultura;Volumen 15, número 1 (Enero-Junio 2018)
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